MirGeneDB ID | Lpo-Mir-375-P10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-375 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGUUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Lpo-Mir-375-P8 Lpo-Mir-375-P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-375 Aca-Mir-375 Ami-Mir-375 Asu-Mir-375 Bfl-Mir-375 Bge-Mir-375 Bla-Mir-375 Bpl-Mir-375 Bta-Mir-375 Cbr-Mir-375 Cel-Mir-375 Cfa-Mir-375 Cin-Mir-375 Cli-Mir-375 Cpi-Mir-375 Cpo-Mir-375 Cte-Mir-375 Dan-Mir-375 Dma-Mir-375 Dme-Mir-375 Dmo-Mir-375 Dno-Mir-375 Dpu-Mir-375 Dsi-Mir-375 Dya-Mir-375 Ebu-Mir-375 Efe-Mir-375 Esc-Mir-375 Ete-Mir-375 Gga-Mir-375 Gja-Mir-375 Hme-Mir-375 Hsa-Mir-375 Isc-Mir-375 Lan-Mir-375 Lch-Mir-375 Lgi-Mir-375 Loc-Mir-375 Mdo-Mir-375 Mml-Mir-375 Mmu-Mir-375 Npo-Mir-375 Oan-Mir-375 Obi-Mir-375 Ocu-Mir-375 Ovu-Mir-375 Pbv-Mir-375 Pfl-Mir-375 Pmi-Mir-375 Rno-Mir-375 Sha-Mir-375 Sko-Mir-375 Spt-Mir-375 Spu-Mir-375 Sto-Mir-375 Tca-Mir-375 Tgu-Mir-375 Xtr-Mir-375 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013669730.1: 10721-10776 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGGAUGGAUUAAGUAAUUACUGCUACUUGACUUGAGCUGUCUGGGCAGAACUUUGGAAAAUGUUUUGUUCGUUCGGCUCGAGUCAGAAAGUGGUUCAAAUGUCACCAGAUUCACCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GAGGAUGGAUUAAGUAAUU--| UG AC UC UUUG AC CU UUGACUUGAGCUG UGGGCAGAAC G UG GA GACUGAGCUCGGC GCUUGUUUUG A CCACUUAGACCACUGUAAACU^ GU AA UU UAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Lpo-Mir-375-P10_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUUGAGCUGUCUGGGCAGAAC -22
Get sequence
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Mature sequence | Lpo-Mir-375-P10_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- UUUGUUCGUUCGGCUCGAGUCA -56
Get sequence
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