| MirGeneDB ID | Cel-Mir-1829-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1829 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-1829b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cel-Mir-1829-P1 Cel-Mir-1829-P3 Cel-Mir-1829-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrX: 14977119-14977178 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGCGAUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUUAAAUCCUUUGUUAUGUUAUUAUAAGUAAGCGAUCUUCUAGAUGGUUGUAAAACAUCGAGUAUUACAACCACUGGAAUUUCUCUAUUACCUUUUUGGAUGGGCAAAGUUGUAGUACUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCUUAAAUCCUUUGUUAUGUUAUUAUAA --| C UC A AAACAU GUA AG GA UUCUAG UGGUUGUA \ CAU UC CU AAGGUC ACCAACAU C UCAUGAUGUUGAAACGGGUAGGUUUUUC UA^ U UU - UAUGAG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cel-Mir-1829-P2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0006770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGCGAUCUUCUAGAUGGUUGUA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0006770 TargetScanWorm: cel-miR-1829b |
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| Star sequence | Cel-Mir-1829-P2_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0032037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CAACCACUGGAAUUUCUCUAUU -60
Get sequence
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