MirGeneDB ID | Cpo-Mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-491 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUGGGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cpo-mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-491 Cfa-Mir-491 Dno-Mir-491 Hsa-Mir-491 Mml-Mir-491 Mmu-Mir-491 Ocu-Mir-491 Rno-Mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (cavPor3) |
scaffold_21: 452989-453044 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGCUGCUGUGGGCAUUGACUUAGCUGGGCAGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGAGUAGAACACUCCUUAUGUAAGAUUCCCCUCUGCCUGGCUGGGUUGGAGUCAUAGCCUCCUCUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGGCUGCUGUGGGCAUU--| UG U CC C GUAG GACUUAGC GGCAG GGGGAA CUU CAUGAGGA \ UUGGGUCG CCGUC CCCCUU GAA GUAUUCCU A GUCUCCUCCGAUACUGAGG^ GU U A- U CACA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cpo-Mir-491_5p |
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mirBase accession | MIMAT0047285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGA -23
Get sequence
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Star sequence | Cpo-Mir-491_3p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- CUUAUGUAAGAUUCCCCUCUGC -56
Get sequence
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