MirGeneDB ID | Dno-Mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-197 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCACCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-197 Cfa-Mir-197 Cpo-Mir-197 Hsa-Mir-197 Mml-Mir-197 Ocu-Mir-197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH562706: 297874-297934 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUGCUGGAAUCUGUGCUCCGGGGGCUGUGCCGGGUAGAGAGGGCAGUGGGAGGUAAGAGCUCUUCACCCUUCACCACCUUCUCCACUCAGCAUGGCCGGCACACUUUGGUCUACGGCACAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CUGCUGGAAUCUGUGCUCCGGG--| C A CA GA UAAGAG GGCUGUGC GGGU GAGAGGG GUGG GG \ CCGGUACG CUCA CUCUUCC CACU CC C UACACGGCAUCUGGUUUCACACGG^ A C AC UC ACUUCU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-197_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGGGUAGAGAGGGCAGUGGGAGG -23
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-197_3p |
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mirBase accession | MIMAT0047736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UUCACCACCUUCUCCACUCAGC -61
Get sequence
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