MirGeneDB ID | Dno-Mir-506-P7i | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUGACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-506-P1 Dno-Mir-506-P2 Dno-Mir-506-P3 Dno-Mir-506-P7f Dno-Mir-506-P7g Dno-Mir-506-P7h | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-506-P7 Mmu-Mir-506-P7 Rno-Mir-506-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. novemcinctus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH564535: 672065-672122 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P7i) |
Mir-506-P2
JH564535: 655807-655864 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P3 JH564535: 697744-697800 [+] UCSC Ensembl Mir-506-P7f JH564535: 715717-715774 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGAUCUUCAAGCAUACUGUGUGUGGUACCCUACUCCAGAGAGUGACAAUCACGUAUAAGUAAAUAUGAUUGACACCUCUGAGAGUGGAGUAAUGCAUGACAUAUACGACAUAUGUGAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CGAUCUUCAAGCAUACU- - GG C -| A A CGUAUA GU GUGU UAC CUACUC CAGAG GUG CAAUCA A CA UACG AUG GGUGAG GUCUC CAC GUUAGU G UAGUGUAUACAGCAUAUA G UA A A^ - A AUAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-506-P7i_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACUCCAGAGAGUGACAAUCA -21
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-506-P7i_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AUUGACACCUCUGAGAGUGGA -58
Get sequence
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