MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1929 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCUAGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-1929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr10: 44359692-44359755 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGUGGGAUCCUGAUUAGAACUGGGAGGUCUUCUAGGACUUUAUAGAGCAGAGGUUUGCAGCCUGUGACACUCAGCUCAUGGAGACCUAGGUGGCCUUGGGUUCUGAGCACCAGACAGGACUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GAGUGGGAUCCUGAUUA---| G G U A A A GUUUGCAG GAACU G AGGUC UCUAGG CUUUAU GAGC GAG \ CUUGG U UCCGG GGAUCC GAGGUA CUCG CUC C GUUCAGGACAGACCACGAGU^ G - U A - A ACAGUGUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-1929_5p |
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mirBase accession | MIMAT0009392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCUAGGACUUUAUAGAGCAGAG -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0009392 TargetScanVert: mmu-miR-1929-5p miRDB: MIMAT0009392 |
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Star sequence | Mmu-Mir-1929_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0022729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- CAGCUCAUGGAGACCUAGGUGG -64
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1929-3p miRDB: MIMAT0022729 |