| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-22-P1b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-22 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGCUGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-22-P1b Ami-Mir-22-P1b Bfl-Mir-22-o1b Bfl-Mir-22-P1 Bla-Mir-22-o1b Bla-Mir-22-P1 Bpl-Mir-22-P1 Bta-Mir-22-P1b Cfa-Mir-22-P1b Cgi-Mir-22-P1 Cli-Mir-22-P1b Cmi-Mir-22-P1b Cpi-Mir-22-P1b Cpo-Mir-22-P1b Cte-Mir-22-P1 Dno-Mir-22-P1b Dre-Mir-22-P1b1 Dre-Mir-22-P1b2 Esc-Mir-22-P1 Ete-Mir-22-P1b Gga-Mir-22-P1b Gja-Mir-22-P1b Gmo-Mir-22-P1b1 Gmo-Mir-22-P1b2 Hsa-Mir-22-P1b Lan-Mir-22-P1 Lch-Mir-22-P1b Lgi-Mir-22-P1 Loc-Mir-22-P1b Mal-Mir-22-P1b1 Mal-Mir-22-P1b2 Mdo-Mir-22-P1b Mml-Mir-22-P1b Mun-Mir-22-P1b Npo-Mir-22-P1 Oan-Mir-22-P1b Obi-Mir-22-P1 Ocu-Mir-22-P1b Ovu-Mir-22-P1 Pbv-Mir-22-P1b Pfl-Mir-22-P1 Rno-Mir-22-P1b Sha-Mir-22-P1b Sme-Mir-22-P1 Spt-Mir-22-P1b Sto-Mir-22-P1b Tgu-Mir-22-P1b Tni-Mir-22-P1b1 Tni-Mir-22-P1b2 Xla-Mir-22-P1b3 Xla-Mir-22-P1b4 Xtr-Mir-22-P1b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr11: 75463734-75463793 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCCCACACCCUCACCUGGCUGAGCCGCAGUAGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUAUGUCCUGACCCAGCUAAAGCUGCCAGUUGAAGAACUGUUGCCCUCUGCCCCUGGCUUCGUGGAGGAAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UCCCACACCCUCACCUG---| U CC - A UGUCCU GC GAG GCAGUAGUUCUUCAG UGGCA GCUUUA G CG CUC CGUUGUCAAGAAGUU ACCGU CGAAAU A GAAGGAGGUGCUUCGGUCCC^ U C- G - CGACCC . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mmu-Mir-22-P1b_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0004629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUUCUUCAGUGGCAAGCUUUA -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004629 TargetScanVert: mmu-miR-22-5p miRDB: MIMAT0004629 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mmu-Mir-22-P1b_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0000531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU -60
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000531 TargetScanVert: mmu-miR-22-3p miRDB: MIMAT0000531 |
