MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3095 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGACACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-3095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr4: 58441023-58441085 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGCCGAGGAUCCACCCAGAGCCCUGUGCACAAGCUUUCUCAUCUGUGACACUCGAGAUGGUUUCAGGGAGUGGACACUGGAGAGAGAGCUUUUGCAAGUCGCUCCUCAUGCCUUGUGGGGUAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CGCCGAGGAUCCACCCA-- CCUG C A - A-| CGAGAUG GAGC UGCA AAGCUUUCUC UCU GUG CACU G CUCG ACGU UUCGAGAGAG AGG CAC GUGA U GAUGGGGUGUUCCGUACUC CUGA U - U AG^ GGGACUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmu-Mir-3095_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0014911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAGCUUUCUCAUCUGUGACACU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3095-5p miRDB: MIMAT0014911 |
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Mature sequence | Mmu-Mir-3095_3p |
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mirBase accession | MIMAT0014912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UGGACACUGGAGAGAGAGCUUUU -63
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3095-3p miRDB: MIMAT0014912 |