MirGeneDB ID | Mmu-Mir-671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-671 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGAAGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-671 Cfa-Mir-671 Cpo-Mir-671 Dno-Mir-671 Ete-Mir-671 Hsa-Mir-671 Mml-Mir-671 Ocu-Mir-671 Rno-Mir-671 Sha-Mir-671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr5: 24592132-24592191 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGCUGGCGAACUGGCAGGCCAGGAAGAGGAGGAAGCCCUGGAGGGGCUGGAGGUGAUGGAUGUUUUCCUCCGGUUCUCAGGGCUCCACCUCUUUCGAGCCGUAGAGCCAGGGCUGGUGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGCUGGCGAACUGGCA--| CA A A GA UGAUGG GGC GGAAGAGG GGA GCCCUG GGGGCUGGAGG \ CCG CUUUCUCC CCU CGGGAC UCUUGGCCUCC A CGUGGUCGGGACCGAGAUG^ AG A - -- UUUUGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-671_5p |
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mirBase accession | MIMAT0003731 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGAAGCCCUGGAGGGGCUGGAGG -24
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003731 TargetScanVert: mmu-miR-671-5p miRDB: MIMAT0003731 |
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Star sequence | Mmu-Mir-671_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UCCGGUUCUCAGGGCUCCACC -60
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004821 TargetScanVert: mmu-miR-671-3p miRDB: MIMAT0004821 |