| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-877 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-877 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-877 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-877 Cfa-Mir-877 Cja-Mir-877 Ete-Mir-877 Hsa-Mir-877 Laf-Mir-877 Mml-Mir-877 Mmr-Mir-877 Pab-Mir-877 Rno-Mir-877 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr17: 35960730-35960814 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGAGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAUGACACUGCUGCUGAGAAACUAGAAAAGGUAGAGGAGAUGGCGCAGGGGACACAAGGUAGGCCUUGCGGGUCUGUGGACCCUUGGACAUGUGUCCUCUUCUCCCUCCUCCCAGGUGUAUGAGGAACUGCGAGCUACCGGGGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 GAUGACACUGCUGCUGAGAAACUAGAAAA---| UA AU CGC CAAGGUAGGCCUUGCGGG GG GAGGAG GG AGGGGACA U CC CUCCUC CC UCUCCUGU C ACGGGGCCAUCGAGCGUCAAGGAGUAUGUGGA^ -- -- UCU GUACAGGUUCCCAGGUGU 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | Mir-877 is a conserved mirtron cut at both ends by the spliceosome. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-877_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0004861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAGAGGAGAUGGCGCAGGGGACA -24
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004861 TargetScanVert: mmu-miR-877-5p miRDB: MIMAT0004861 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-877_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004862 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
64- UCCUCUUCUCCCUCCUCCCAG -85
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004862 TargetScanVert: mmu-miR-877-3p miRDB: MIMAT0004862 |






