MirGeneDB ID | Mmu-Mir-879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-879 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAGGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Rno-Mir-879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr5: 9375714-9375769 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAGAGAUUCACAAGACAAGUUUCUAGGUCCAGAGGCUUAUAGCUCUAAGCCUUGGAUGAAAGAGGCUUAUGGCUUCAAGCUUUCGGAGCUGGAGACUUACUGCUCUUCGUGGUCAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CAGAGAUUCACAAGACA--| G AG AU C UGGA AGUUUCUAG UCC AGGCUU AGCU UAAGCCU U UCAGAGGUC AGG UUCGAA UCGG AUUCGGA G AACUGGUGCUUCUCGUCAU^ G CU CU U GAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-879_5p |
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mirBase accession | MIMAT0004842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGAGGCUUAUAGCUCUAAGCCU -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004842 TargetScanVert: mmu-miR-879-5p miRDB: MIMAT0004842 |
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Star sequence | Mmu-Mir-879_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- GCUUAUGGCUUCAAGCUUUCGG -56
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004843 TargetScanVert: mmu-miR-879-3p miRDB: MIMAT0004843 |