MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P4e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAUUGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-509-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-506-P1 Mml-Mir-506-P2 Mml-Mir-506-P3 Mml-Mir-506-P4d Mml-Mir-506-P4f Mml-Mir-506-P5 Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b1 Mml-Mir-506-P6b2 Mml-Mir-506-P6c1 Mml-Mir-506-P6c2 Mml-Mir-506-P7a Mml-Mir-506-P8 Mml-Mir-506-P9 Mml-Mir-506-P10 Mml-Mir-506-P11 Mml-Mir-506-P12 Mml-Mir-506-P13 Mml-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cpo-Mir-506-o4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. mulatta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 140966427-140966484 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P4e) |
Mir-506-P6c1
chrX: 140924370-140924427 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P6a chrX: 140933343-140933400 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1 chrX: 140946831-140946887 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2 chrX: 140947157-140947214 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P3 chrX: 140953023-140953080 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P8 chrX: 140957066-140957123 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P4e chrX: 140966427-140966484 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P5 chrX: 140974554-140974611 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P7a chrX: 140981185-140981242 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCAUCCUCAGACAUGCUGUGUGUGGUACCCUACUACAGGCAGUGGCAAUCAUGUAUAGUUAAAAAUGAUUGGUAUGUCUGUGGGUAGAGUAAUGCAUGACACAUGCAACAUACAUGAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCAUCCUCAGACAUGCU- - GG C -| G G GUAUA GU GUGU UAC CUA CUACAGGCA UG CAAUCAU G CA UACG AUG GAU GGUGUCUGU AU GUUAGUA U UAGUACAUACAACGUACA G UA A G^ - G AAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-506-P4e_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACUACAGGCAGUGGCAAUCAUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Mml-Mir-506-P4e_3p |
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mirBase accession | MIMAT0005765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UGAUUGGUAUGUCUGUGGGUAGA -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-509 |