MirGeneDB ID | Dno-Mir-12086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-12086 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUUCGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-12086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. novemcinctus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. novemcinctus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH562324: 969379-969437 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-12086) |
Mir-12086
JH562324: 969379-969437 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-2114 JH562324: 969560-969619 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCAGGCAGGGGCACAGGCCUCCUGGGUCUGCUUUCGGCGCCUAGGAUUCGGUGAAAGCUCGAGUGACAGAAUCCUAGAGCUGAAAAGCACCUCAAGAAGCCAUCGGUCCAACCCUGUUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UCAGGCAGGGGCACAGGCC---| C UC - GC G GAAAGC UC UGGG UGCUUU CGGC CUAGGAUUC GU \ AG ACUC ACGAAA GUCG GAUCCUAAG CA U UUUGUCCCAACCUGGCUACCGA^ A C- A A- A GUGAGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dno-Mir-12086_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0048071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUUUCGGCGCCUAGGAUUCGGU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dno-Mir-12086_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0048072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AGAAUCCUAGAGCUGAAAAGCA -59
Get sequence
|