MirGeneDB ID | Dno-Mir-136-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-136 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCAUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-136-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-136-v1 Cfa-Mir-136-v1 Cpo-Mir-136-v1 Ete-Mir-136-v1 Hsa-Mir-136-v1 Mml-Mir-136-v1 Mmu-Mir-136-v1 Ocu-Mir-136-v1 Rno-Mir-136-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-136-v1) |
Mir-433
JH578221: 4095-4168 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-127 JH578221: 5211-5266 [+] UCSC Ensembl Mir-432 JH578221: 6661-6729 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 JH578221: 6860-6915 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCGCGGCGGCGUCGGAUGAGCCCUCGGAGGACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGGAUUCCUACGCUCCAUCAUCGUCUCAAAUGAGUCUUCAGAGGGUUCCAUCAUGUCUUCGGAUGGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCGCGGCGGCGUCGGAU--| G C UUU UUCC GAGCCCUC GAGGACUC AUUUG UGAUGAUGGA \ CUUGGGAG CUUCUGAG UAAAC GCUACUACCU U CGGUAGGCUUCUGUACUAC^ A - UCU CGCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-136-v1_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0047644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGGA -23
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-136-v1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0047645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- CAUCAUCGUCUCAAAUGAGUCU -56
Get sequence
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