MirGeneDB ID | Dno-Mir-204-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-204 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCCUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-204-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-204-P1 Ami-Mir-204-P1 Bta-Mir-204-P1 Cfa-Mir-204-P1 Cli-Mir-204-P1 Cmi-Mir-204-P1 Cpi-Mir-204-P1 Cpo-Mir-204-P1 Dre-Mir-204-P1a Dre-Mir-204-P1b Ebu-Mir-204 Gga-Mir-204-P1 Gja-Mir-204-P1 Gmo-Mir-204-P1a Gmo-Mir-204-P1b Hsa-Mir-204-P1 Lch-Mir-204-P1 Loc-Mir-204-P1 Mal-Mir-204-P1b Mdo-Mir-204-P1 Mml-Mir-204-P1 Mmu-Mir-204-P1 Mun-Mir-204-P1 Oan-Mir-204-P1 Ocu-Mir-204-P1 Pbv-Mir-204-P1 Pma-Mir-204 Rno-Mir-204-P1 Sha-Mir-204-P1 Spt-Mir-204-P1 Sto-Mir-204-P1 Tgu-Mir-204-P1 Tni-Mir-204-P1b Xla-Mir-204-P1c Xla-Mir-204-P1d Xtr-Mir-204-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH582005: 579275-579331 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCCACCCAGCUGGCCAUGGGACCUGUGGGCUUCCCUUUGUCAUCCUUUGCCUAGGAUCCGAGUGGGGCAGGGACAACAAAGGGGUGCUCAGGCGUCACCUCCACAACAUGCCAAGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCCACCCAGCUGGCCAU- - -| G U CA U AGGAU GG GAC CU UGGGC UCCCUUUGU UCCUU GCCU C CC CUG GG ACUCG GGGGAAACA AGGGA CGGG C AAGAACCGUACAACACCU A C^ - U AC - GUGAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dno-Mir-204-P1_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0047756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCCCUUUGUCAUCCUUUGCCU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dno-Mir-204-P1_3p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0047757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- GCAGGGACAACAAAGGGGUGC -57
Get sequence
|