MirGeneDB ID | Dno-Mir-337-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-337 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCUAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-337-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cpo-Mir-337-v2 Hsa-Mir-337-v2 Mml-Mir-337-v2 Mmu-Mir-337 Ocu-Mir-337-v2 Rno-Mir-337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH568228: 2142-2201 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-337-v2) |
Mir-337-v1
JH568228: 2142-2201 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-337-v2 JH568228: 2142-2201 [-] UCSC Ensembl Mir-493 JH568228: 5543-5604 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGCCGCGGCCCGGCAGUAGGUGGGGGGUGGGAACGGCUUCAUACAGGAGUUGGUGGACAGUUAUCCAGCUCCUAUAUGAUGCCUUUCUUCAUCCCCUUCGACCGCGCGCAGCAGCCCCGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GGCCGCGGCCCGGCAGUA---| U - C U C GGUGGAC GG GGGGGGUGG GAA GGC UCAUA AGGAGUU \ CU UCCCCUACU CUU CCG AGUAU UCCUCGA A GGCCCCGACGACGCGCGCCAG^ - U U U A CCUAUUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-337-v2_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0047817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GAACGGCUUCAUACAGGAGUU -21
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-337-v2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0047818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CUCCUAUAUGAUGCCUUUCUUC -60
Get sequence
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