MirGeneDB ID | Dno-Mir-342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-342 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUCACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-342 Cfa-Mir-342 Cpo-Mir-342 Ete-Mir-342 Hsa-Mir-342 Mml-Mir-342 Mmu-Mir-342 Ocu-Mir-342 Rno-Mir-342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH561489: 96895-96961 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCUCAAGCCCAGAAACGGGGCUCAAGGUGAGGGGUGCUAUCUGUGAUUGAGGGACAUGGUAAAUGGAAUUGUCUCACACAGAAAUCGCACCCGUCACCUUGGCCUGCGUAGCACCACCCCCUCAGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCUCAAGCCCAGAAACG--- U G UA--| AUUGA UGGUAA GGGC CAAGGUGA GGGUGC UCUGUG GGGACA \ UCCG GUUCCACU CCCACG AGACAC CUCUGU A CGACUCCCCCACCACGAUGCG - G CUAA^ A---- UAAGGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-342_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGGGUGCUAUCUGUGAUUGAGGGACA -27
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-342_3p |
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mirBase accession | MIMAT0047826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUCA -67
Get sequence
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