MirGeneDB ID | Dya-Mir-210-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-210 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGUGCGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dya-Mir-210-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-210-v1 Aca-Mir-210 Ami-Mir-210 Bfl-Mir-210 Bge-Mir-210-v1 Bla-Mir-210 Bta-Mir-210 Cfa-Mir-210 Cgi-Mir-210 Cli-Mir-210 Cmi-Mir-210 Cpi-Mir-210 Cpo-Mir-210 Dan-Mir-210-v1 Dma-Mir-210 Dme-Mir-210-v1 Dmo-Mir-210-v1 Dno-Mir-210 Dpu-Mir-210 Dre-Mir-210 Dsi-Mir-210-v1 Ebu-Mir-210 Efe-Mir-210 Ete-Mir-210 Gga-Mir-210 Gja-Mir-210 Gmo-Mir-210 Hsa-Mir-210 Isc-Mir-210 Lan-Mir-210 Lch-Mir-210 Lgi-Mir-210 Loc-Mir-210 Mal-Mir-210 Mdo-Mir-210 Mml-Mir-210 Mmu-Mir-210 Mun-Mir-210 Npo-Mir-210 Oan-Mir-210 Ocu-Mir-210 Pbv-Mir-210 Pma-Mir-210 Pmi-Mir-210-v1 Rno-Mir-210 Sha-Mir-210 Sko-Mir-210 Spt-Mir-210 Spu-Mir-210-v1 Tca-Mir-210-v1 Tgu-Mir-210 Tni-Mir-210 Xtr-Mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
X: 16646342-16646400 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-210-v1) |
Mir-210-v1
X: 16646342-16646400 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-210-v2 X: 16646342-16646400 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCAUGUCGCGAACCGAAAGGUACUUAUUGCAGCUGCUGGCCACUGCACAAGAUUAGACUUAAGACUCUUGUGCGUGUGACAGCGGCUAUUGUAAGAGGCCAUAGAAGCAACAACCAGCCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCAUGUCGCGAACCGAAA- A-| UGC GC - UUAGAC GGU CUUAU AGCUGCUG CAC UGCACAAGA \ CCG GAAUG UCGGCGAC GUG GCGUGUUCU U CCGACCAACAACGAAGAUA GA^ UUA A- U CAGAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dya-Mir-210-v1_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGCUGCUGGCCACUGCACAAGA -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dya-Mir-210-v1_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0009095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UUGUGCGUGUGACAGCGGCUAU -59
Get sequence
|