MirGeneDB ID | Dya-Mir-276-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-276 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGGAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-276b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dya-Mir-276-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-276-P1 Bge-Mir-276 Dan-Mir-276-P1 Dma-Mir-276 Dme-Mir-276-P1 Dmo-Mir-276-P1 Dpu-Mir-276 Dsi-Mir-276-P1 Hme-Mir-276 Isc-Mir-276 Tca-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Diptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
3L: 10302168-10302225 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-276-P1) |
Mir-276-P1
3L: 10302168-10302225 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-276-P2 3L: 10348902-10348960 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAACAAAAAACCGAAGUCUUUUUACCAUCAGCGAGGUAUAGAGUUCCUACGUUCCUAUUCAGUCGUAGGAACUUAAUACCGUGCUCUUGGAGGACUGUCGACCAUCAUAAAGUUAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AGAACAAAAAACCGAAGUCUUUUUA--| UC A A UUCCU CCA AGCG GGUAU GAGUUCCUACG A GGU UCGU CCAUA UUCAAGGAUGC U AAAUUGAAAUACUACCAGCUGUCAGGA^ UC G A UGACU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dya-Mir-276-P1_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGCGAGGUAUAGAGUUCCUACG -22
Get sequence
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Mature sequence | Dya-Mir-276-P1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0009125 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UAGGAACUUAAUACCGUGCUCU -58
Get sequence
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