MirGeneDB ID | Mml-Mir-450-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-450 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUUGCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-450b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-450-P1 Mml-Mir-450-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-450-P3 Cfa-Mir-450-P3 Cpo-Mir-450-P3 Dno-Mir-450-P3 Hsa-Mir-450-P3 Mmu-Mir-450-P3 Ocu-Mir-450-P3 Rno-Mir-450-P3a Rno-Mir-450-P3b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 128511991-128512048 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-450-P3) |
Mir-450-P3
chrX: 128511991-128512048 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-450-P2 chrX: 128512154-128512210 [-] UCSC Ensembl Mir-450-P1 chrX: 128512325-128512381 [-] UCSC Ensembl Mir-542-v1 chrX: 128513154-128513212 [-] UCSC Ensembl Mir-542-v2 chrX: 128513155-128513211 [-] UCSC Ensembl Mir-15-P2c chrX: 128518112-128518174 [-] UCSC Ensembl Mir-15-P1c chrX: 128518445-128518503 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCUGUGAUAAAUGUAAGAUGCAGAAUUAUUUUUGCAAUAUGUUCCUGAAUAUGUAGUAUAAGCGUAUUGGGAUCAUUUUGCAUCCAUAGUUUUGUAUCAACAUAUGGAGAAAAGUCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUCUGUGAUAAAUGUAA--| UUU U U G GUAGU GAUGCAGAAUUAU UGCAA AUG UCCU AAUAU \ CUAUGUUUUGAUA ACGUU UAC AGGG UUAUG A UCUGAAAAGAGGUAUACAA^ CCU U U - CGAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-450-P3_5p |
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mirBase accession | MIMAT0006333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUUGCAAUAUGUUCCUGAAUAU -23
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-450b-5p |
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Star sequence | Mml-Mir-450-P3_3p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0006334 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- AUUGGGAUCAUUUUGCAUCCAU -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-450b-3p |