MirGeneDB ID | Dno-Mir-670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-670 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUCCUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-670 Cpo-Mir-670 Hsa-Mir-670 Mml-Mir-670 Mmu-Mir-670 Ocu-Mir-670 Rno-Mir-670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH569711: 1280291-1280354 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-670) |
Mir-129-P1
JH569711: 1257306-1257369 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-670 JH569711: 1280291-1280354 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCCACAUCCCGUUUGGGGGUGGAUCUGACGUCCCUGAGUGUAUGUGGUGAACCUGAAUUUGCCUUGGGUUUCCUCAUAUUCAUUCAGGAGUGUCAGUUCCCCCUUUACUCAACGUUGGAGAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCCACAUCCCGUUUGG---| U U UC U - UG UGAAUU GGG GGA CUGACG CCUGAGUG AUGUG G AACC \ CCC CCU GACUGU GGACUUAC UAUAC C UUGG U CAAGAGGUUGCAACUCAUUU^ - U GA U U CU GUUCCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-670_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0047996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUCCCUGAGUGUAUGUGGUGAACC -24
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-670_3p |
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mirBase accession | MIMAT0047997 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UUUCCUCAUAUUCAUUCAGGAGUGU -64
Get sequence
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