MirGeneDB ID | Dno-Mir-92-P2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-92-P1a Dno-Mir-92-P1c Dno-Mir-92-P1d Dno-Mir-92-P2c Dno-Mir-92-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-92-P2a Ami-Mir-92-P2a Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o2 Bla-Mir-92-o2 Bta-Mir-92-P2a Cel-Mir-92 Cfa-Mir-92-P2a Cli-Mir-92-P2a Cmi-Mir-92-P2a Cpi-Mir-92-P2a Cpo-Mir-92-P2a Esc-Mir-92 Ete-Mir-92-P2a Gga-Mir-92-P2a Gja-Mir-92-P2a Hsa-Mir-92-P2a Isc-Mir-92 Mdo-Mir-92-P2a Mml-Mir-92-P2a Mmu-Mir-92-P2a Mun-Mir-92-P2a Oan-Mir-92-P2a Obi-Mir-92 Ocu-Mir-92-P2a Rno-Mir-92-P2a Sha-Mir-92-P2a Sme-Mir-92 Spt-Mir-92-P2a Sto-Mir-92-P2a Tgu-Mir-92-P2a Xla-Mir-92-P2a Xtr-Mir-92-P2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH580080: 1519066-1519125 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P2a) |
Mir-92-P2a
JH580080: 1519066-1519125 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P4 JH580080: 1519185-1519244 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P3 JH580080: 1519344-1519404 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P2 JH580080: 1519526-1519585 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P1 JH580080: 1519661-1519717 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAUCUAUAUUGCUGGGAGUUACAGGCCACUACUGUUGCUAAUAUGCAACUCUGUUCAAUAUAAAGUGGAAUUGCACUUUAGCAAUGGUGAUGGAGUGUGUCAAUUGCCGGCAGUGAAAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UAUCUAUAUUGCUGGGAGU--| GG C UA C GUUCAA UACA CCA UACUGUUGCUAA UGCAA UCU U GUGU GGU GUGGUAACGAUU ACGUU AGG A UUAAAGUGACGGCCGUUAACU^ GA A UC A UGAAAU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-92-P2a_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUGUUGCUAAUAUGCAACUCU -22
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-92-P2a_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA -60
Get sequence
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