MirGeneDB ID | Dno-Mir-95-P3-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGAGUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-95-P1 Dno-Mir-95-P2 Dno-Mir-95-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-95-P3-v1 Bta-Mir-95-P3-v2 Cfa-Mir-95-P3-v1 Cfa-Mir-95-P3-v2 Cpo-Mir-95-P3 Hsa-Mir-95-P3-v1 Hsa-Mir-95-P3-v2 Mml-Mir-95-P3-v1 Mml-Mir-95-P3-v2 Ocu-Mir-95-P3-v1 Ocu-Mir-95-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH568995: 131983-132043 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-95-P3-v1) |
Mir-95-P3-v1
JH568995: 131983-132043 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-95-P3-v2 JH568995: 131984-132042 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 JH568995: 132148-132199 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCCAGAGCCCAGCCUGGCACAUUAGUAGGCCUGAGUAAAUGUUUAUUGGAUGAAUAAAUGAAUGACUCAUCAACAAACAUUUAUUGUGUGCCUGCUAAAGUGAUCUCCACGGGCUCUGGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UCCAGAGCCCAGCCUGG-- A CUG-| AUUG AAUAAAU CAC UUAGUAGGC AGUAAAUGUUU GAUG \ GUG AAUCGUCCG UUAUUUACAAA CUAC G CAGGUCUCGGGCACCUCUA A UGUG^ CAA- UCAGUAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dno-Mir-95-P3-v1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0047973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGAGUAAAUGUUUAUUGGAUG -22
Get sequence
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Star sequence | Dno-Mir-95-P3-v1_3p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UCAACAAACAUUUAUUGUGUGC -61
Get sequence
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