MirGeneDB ID | Mml-Mir-95-P3-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUCAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-95-P1 Mml-Mir-95-P2 Mml-Mir-95-P3-v2 Mml-Mir-95-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-95-P3-v1 Bta-Mir-95-P3-v2 Cfa-Mir-95-P3-v1 Cfa-Mir-95-P3-v2 Cpo-Mir-95-P3 Dno-Mir-95-P3-v1 Dno-Mir-95-P3-v2 Hsa-Mir-95-P3-v1 Hsa-Mir-95-P3-v2 Ocu-Mir-95-P3-v1 Ocu-Mir-95-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 68840445-68840507 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-95-P3-v1) |
Mir-95-P3-v1
chrX: 68840445-68840507 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-95-P3-v2 chrX: 68840446-68840505 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 chrX: 68840617-68840668 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCCAGAGCCCAGCCUGGCACAUUAGUAGGCCUCAGUAAAUGUUUAUUAGAUGAAUAAAUGAAUGACUCAUCAGCAAACAUUUAUUGUGUGCCUGCUAAAGUGAGCUCCACAGGCUCUGGACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCCAGAGCCCAGCCUGG-- A CU-| A A AAUAAAU CAC UUAGUAGGC CAGUAAAUGUUU UU GAUG \ GUG AAUCGUCCG GUUAUUUACAAA GA CUAC G UCAGGUCUCGGACACCUCGA A UGU^ C - UCAGUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-95-P3-v1_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUCAGUAAAUGUUUAUUAGAUG -23
Get sequence
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Star sequence | Mml-Mir-95-P3-v1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0006409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UCAGCAAACAUUUAUUGUGUGCC -63
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-545 |