| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-7-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-7 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAAGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-7b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-7-P1 Mmu-Mir-7-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-7 Aca-Mir-7-P4 Ami-Mir-7-P4 Asu-Mir-7 Bfl-Mir-7 Bge-Mir-7 Bla-Mir-7 Bta-Mir-7-P4 Cfa-Mir-7-P4 Cgi-Mir-7 Cin-Mir-7 Cli-Mir-7-P4 Cmi-Mir-7-P4 Cpi-Mir-7-P4 Cpo-Mir-7-P4 Cte-Mir-7 Dan-Mir-7 Dma-Mir-7 Dme-Mir-7 Dmo-Mir-7 Dno-Mir-7-P4 Dre-Mir-7-P4b Dsi-Mir-7 Dya-Mir-7 Esc-Mir-7 Ete-Mir-7-P4 Gga-Mir-7-P4 Gja-Mir-7-P4 Gmo-Mir-7-P4a Hme-Mir-7 Hsa-Mir-7-P4 Isc-Mir-7 Lan-Mir-7 Lch-Mir-7-P4 Lgi-Mir-7 Loc-Mir-7-P4 Loc-Mir-7-P4-as Lpo-Mir-7 Mal-Mir-7-P4a Mdo-Mir-7-P4 Mml-Mir-7-P4 Mun-Mir-7-P4 Npo-Mir-7 Obi-Mir-7 Ocu-Mir-7-P4 Ovu-Mir-7 Pbv-Mir-7-P4 Pfl-Mir-7 Pma-Mir-7-o4 Pmi-Mir-7 Rno-Mir-7-P4 Sha-Mir-7-P4 Sko-Mir-7 Spt-Mir-7-P4 Spu-Mir-7 Sto-Mir-7-P4 Tca-Mir-7 Tgu-Mir-7-P4 Xbo-Mir-7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr17: 56243017-56243076 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGGAGCGGAGUACGUGAGCCAGUGCUAUGUGGAAGACUUGUGAUUUUGUUGUUCUGAUAUGAUAUGACAACAAGUCACAGCCAGCCUCAUAGCGUGGACUCCUAUCACCUUUCUCCUGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAGGAGCGGAGUACGUG-- -| G U AAGAC U CUGAU AG CCA UGCUAUG GG UUGUGAUUU GUUGUU A UC GGU GCGAUAC CC GACACUGAA CAACAG U AGUCCUCUUUCCACUAUCC A^ - U GACC- - UAUAG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mmu-Mir-7-P4_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0000678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGAAGACUUGUGAUUUUGUUGUU -24
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000678 TargetScanVert: mmu-miR-7b-5p miRDB: MIMAT0000678 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mmu-Mir-7-P4_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0017071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CAACAAGUCACAGCCAGCCUCA -60
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-7b-3p miRDB: MIMAT0017071 |
