MirGeneDB ID | Dno-Mir-362-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-362 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUGCACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-500b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-362-P1 Dno-Mir-362-P2-v1 Dno-Mir-362-P2-v2 Dno-Mir-362-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-362-P5 Cfa-Mir-362-P5 Cpo-Mir-362-P5 Hsa-Mir-362-P5 Mml-Mir-362-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH569306: 1550649-1550711 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-362-P5) |
Mir-188-P2
JH569306: 1544821-1544879 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-188-P1 JH569306: 1545145-1545204 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P2-v1 JH569306: 1548488-1548549 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P2-v2 JH569306: 1548489-1548548 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P1 JH569306: 1549504-1549562 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P5 JH569306: 1550649-1550711 [+] UCSC Ensembl Mir-188-P3 JH569306: 1554037-1554096 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P4 JH569306: 1556109-1556167 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCUGAAUCUUCUGCUCUAGCUCCUCCUCUCUAAUCCUUGCUACCUGGGUGAGAGUGCUUUUUUGAAUGCAAUGCACCUGGGCAAGGAUUCAGAGAGGGGGCGCUUUAUCUUCAUACAGGACAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CCUGAAUCUUCUGCUCU-- U -| UAC UG AGA- GCUUU AGC CCUCCUCUCU AAUCCUUGC C GGUG GU U UCG GGGGGAGAGA UUAGGAACG G CCAC CG U GACAGGACAUACUUCUAUU C C^ --- GU GUAA UAAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dno-Mir-362-P5_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0047940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAAUCCUUGCUACCUGGGUGAGAGU -25
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dno-Mir-362-P5_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0047941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- AAUGCACCUGGGCAAGGAUUCAGA -63
Get sequence
|