MirGeneDB ID | Dya-Mir-216-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-216 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAUAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dya-Mir-216-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-216-P1 Asu-Mir-216-P1 Bge-Mir-216-P1 Cgi-Mir-216-P1 Cte-Mir-216-P1 Dan-Mir-216-P1 Dma-Mir-216-P1 Dme-Mir-216-P1 Dmo-Mir-216-P1 Dpu-Mir-216-P1 Dsi-Mir-216-P1 Efe-Mir-216-P1a Efe-Mir-216-P1b Esc-Mir-216-P1 Hme-Mir-216-P1 Lan-Mir-216-P1e Lan-Mir-216-P1f Lgi-Mir-216-P1 Tca-Mir-216-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
X: 9587625-9587693 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-216-P1) |
Mir-216-P1
X: 9587625-9587693 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-216-P2 X: 9589360-9589427 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAAGUGUCACCUUACACGAUUCUCAAAGGUAAAUAUCAGCUGGUAAUUCUGGGAGCUAAGCCUAAAUAUGAAACACUCGGAAUUUCAGUUGGUAUCGACUUUUUUGAAUUGCAUUUGAUCACCAUAAGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AAAGUGUCACCUUACAC--| UC AA U AGCUAAGCCU GAUUC AAAGGU AUAUCAGCUGG AAUUCUGGG A UUAAG UUUUCA UAUGGUUGACU UUAAGGCUC A CGAAUACCACUAGUUUACG^ UU GC - ACAAAGUAUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dya-Mir-216-P1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0009064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAAUAUCAGCUGGUAAUUCUGGG -23
Get sequence
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Star sequence | Dya-Mir-216-P1_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
47- CGGAAUUUCAGUUGGUAUCGAC -69
Get sequence
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