MirGeneDB ID | Dya-Mir-92-P6b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-311a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dya-Mir-92-P3 Dya-Mir-92-P4 Dya-Mir-92-P5 Dya-Mir-92-P6a Dya-Mir-92-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o6 Bla-Mir-92-o6 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P6 Dme-Mir-92-P6 Dmo-Mir-92-P6 Dsi-Mir-92-P6 Esc-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. yakuba | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
2R: 12724839-12724897 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P6b) |
Mir-7
2R: 12702754-12702815 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-992 2R: 12723689-12723744 [+] UCSC Ensembl Mir-991 2R: 12723801-12723862 [+] UCSC Ensembl Mir-9681 2R: 12724136-12724190 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P6a 2R: 12724560-12724622 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P7 2R: 12724704-12724764 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P6b 2R: 12724839-12724897 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P5 2R: 12724949-12725008 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAAAAAUAUCUCACUUUCUAGAUAGUUUUGCGGACGGUAUCUGCGUCAAUAUUUCCUUGUUAGAAUAUAUUGCACAUUCACCGGCCUGAAAAUAUCAAGGACUUGCAUCGAAAAGUGCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UAAAAAUAUCUCACUUU---| A G C A AUC C U UUCCUU CU GAUA UUUUG GG CGGU UG G CAAUAU G GA CUAU AAAGU CC GCCA AC C GUUAUA U UCGUGAAAAGCUACGUUCAG^ A A - G CUU A - UAAGAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dya-Mir-92-P6b_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0037349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGGACGGUAUCUGCGUCAAUAUU -23
Get sequence
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Mature sequence | Dya-Mir-92-P6b_3p |
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mirBase accession | MIMAT0009091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UAUUGCACAUUCACCGGCCUGA -59
Get sequence
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