MirGeneDB 2.1
MirGeneDB ID

Ete-Mir-133-P3-v1

Family name MIR-133 (all species)
Seed UUGGUCC
Species Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi)
MiRBase ID
Paralogues Ete-Mir-133-P1-v1  Ete-Mir-133-P1-v2  Ete-Mir-133-P2-v1  Ete-Mir-133-P2-v2  Ete-Mir-133-P3-v2 
Orthologues Aae-Mir-133  Aca-Mir-133-P3-v1  Aca-Mir-133-P3-v2  Ami-Mir-133-P3-v1  Ami-Mir-133-P3-v2  Asu-Mir-133  Bge-Mir-133  Bta-Mir-133-P3-v1  Bta-Mir-133-P3-v2  Cbr-Mir-133  Cel-Mir-133  Cfa-Mir-133-P3-v1  Cfa-Mir-133-P3-v2  Cgi-Mir-133  Cin-Mir-133  Cli-Mir-133-P3-v1  Cli-Mir-133-P3-v2  Cmi-Mir-133-P3-v1  Cmi-Mir-133-P3-v2  Cpi-Mir-133-P3-v1  Cpi-Mir-133-P3-v2  Cpo-Mir-133-P3-v1  Cpo-Mir-133-P3-v2  Cte-Mir-133  Dan-Mir-133  Dma-Mir-133  Dme-Mir-133  Dmo-Mir-133  Dno-Mir-133-P3-v1  Dno-Mir-133-P3-v2  Dpu-Mir-133  Dre-Mir-133-P3-v1  Dre-Mir-133-P3-v2  Dsi-Mir-133  Dya-Mir-133  Efe-Mir-133  Esc-Mir-133  Gga-Mir-133-P3-v1  Gga-Mir-133-P3-v2  Gja-Mir-133-P3-v1  Gja-Mir-133-P3-v2  Gmo-Mir-133-P3-v1  Gmo-Mir-133-P3-v2  Hme-Mir-133  Hsa-Mir-133-P3-v1  Hsa-Mir-133-P3-v2  Isc-Mir-133  Lan-Mir-133  Lch-Mir-133-P3  Lgi-Mir-133  Loc-Mir-133-P3-v1  Loc-Mir-133-P3-v2  Mal-Mir-133-P3-v1  Mal-Mir-133-P3-v2  Mdo-Mir-133-P3-v1  Mdo-Mir-133-P3-v2  Mml-Mir-133-P3-v1  Mml-Mir-133-P3-v2  Mmu-Mir-133-P3-v1  Mmu-Mir-133-P3-v2  Mun-Mir-133-P3-v1  Mun-Mir-133-P3-v2  Oan-Mir-133-P3-v1  Oan-Mir-133-P3-v2  Obi-Mir-133  Ovu-Mir-133  Pbv-Mir-133-P3-v1  Pbv-Mir-133-P3-v2  Pma-Mir-133-o3-v1  Pma-Mir-133-o3-v2  Rno-Mir-133-P3-v1  Rno-Mir-133-P3-v2  Sha-Mir-133-P3-v1  Sha-Mir-133-P3-v2  Spt-Mir-133-P3  Spu-Mir-133  Sto-Mir-133-P3-v1  Sto-Mir-133-P3-v2  Tca-Mir-133  Tgu-Mir-133-P3-v1  Tgu-Mir-133-P3-v2  Xbo-Mir-133  Xla-Mir-133-P3a-v1  Xla-Mir-133-P3a-v2  Xla-Mir-133-P3b-v1  Xla-Mir-133-P3b-v2  Xtr-Mir-133-P3-v1  Xtr-Mir-133-P3-v2 
Node of Origin (locus) Gnathostomata
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(echTel2)		 JH980408: 1064359-1064418 [-] UCSC
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CUGCUCUGCCGGACUCUGAUGCUUUGCUAGAGCUGGUAAAAUGGAACCAGAUCGGCCGUAUGAUGGAUUUGGUCCCCUUCAACCAGCUGUAGCUGCGCAUUGAGGGCACCGCCUGGCCGG
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50         
CUGCUCUGCCGGACUCU--|    UUU    G       AA  U  A        GGCCG 
                   GAUGC   GCUA AGCUGGU  AA GG ACCAGAUC     U
                   UUACG   CGAU UCGACCA  UU CC UGGUUUAG     A
GGCCGGUCCGCCACGGGAG^    CGU    G       AC  C  C        GUAGU 
.       110       100        90        80        70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsUG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17)
Tissue expression
-   +
To
Star sequence

Ete-Mir-133-P3-v1_5p*
mirBase accessionNone
Sequence 
0- AGCUGGUAAAAUGGAACCAGAUC -23
Get sequence
Mature sequence

Ete-Mir-133-P3-v1_3p
mirBase accessionNone
Sequence 
37- UUUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU -60
Get sequence